除纽约地铁G线、纽约地铁法兰克林大道接驳线和纽约地铁洛克威公园接驳线外，纽约地铁所有列车服务都经过曼哈顿 。曼哈顿以外的纽约地铁系统多为架空路段、堤坝路段和地面路段，尽管被称作“地铁”，纽约地铁系统中，约有40%的路轨不在地下 。纽约地铁系统中部分路线设有快车（ExpressTrain）和慢车（LocalService），此类路线通常有三条或四条路轨，通常情况下，两侧的路轨供慢车使用，中间路轨供快车使用 。快车只在主要换乘站和总站停靠 。

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