质粒构建|五步学会质粒构建原理

质粒构建(五步学会质粒构建原理)
质粒构建是分子生物学研究中最常用的实验技术 。原理依赖于限制性核酸内切酶 , DNA连接酶和其他修饰酶的作用 , 分别对目的基因和载体DNA进行适当切割和修饰百思特网后 , 将二者连接在一起 , 再导入宿主细胞 , 实现目的基因在宿主细胞内的正确表达 。
质粒构建方式多样 , 常规的T4连接酶 , 下面就介绍下T4连接酶构建质粒方法 , T4连接酶可百思特网用于平末端也可用于粘性末端连接 , 但一般推荐适用黏性末端 。
质粒构建|五步学会质粒构建原理

1.质粒载体的制备既可以选择单酶切也可以选择双酶切 , 一般推荐使用双酶切 。其实目的就只有一个 , 尽量使载体的末端具有特异性 , 防止自连 。质粒构建|五步学会质粒构建原理

补水至50ul , 37C孵育3~4小时 , 每隔一段时间振荡一下并离心以防液滴蒸发至管盖上 。酶切后载体通过切胶回收线性化载体 。
双酶切1和2百思特网 , 在设置酶切体系时要考虑酶切温度以及 Activity in NEBbuffer的问题 , 可在NEB公司主页的Double Digest Finder里面进行查询 。
2.根据目的序列构建引物后 , 如果目的基因片段只有几十kb的话 , 可以选择退火方式使插入片段成为互补序列 。(1)引物设计方法:举个栗子 , 比如选择的限制性内切酶为BglII与HindIII , 则根据酶切位点序列在引物的两端加粘性末端碱基序列 。
质粒构建|五步学会质粒构建原理

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引物合成形式:5’-GATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-3’
3’-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGA-5’
(2)在PCR仪中按照以下touch down程序运行95C, 5 min; 95–85C at ?2C /s; 85–25C at ?0.1C /s; hold at 4C 。
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3.线性化质粒载体与退火产物进行T4 DNA酶连接 。质粒构建|五步学会质粒构建原理

T4 DNA酶连接一般选择 16℃过夜 。

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注:连接可以选择公式计算 , 一般按照最适克隆载体与插入片段摩尔比为1:2 , 即最适插入片段使用量为0.06 pmol 。这些摩尔数对应的DNA质量可由以下公式粗略计算获得:
最适克隆载体使用量 = [0.02克隆载体碱基对数]ng (0.03 pmol)
最适插入片段使用量 = [0.04插入片段碱基对数]ng (0.06 pmol)
4.转化将连接产物转化到受体菌中(一般为DH5a),涂板,培养过夜 。注意质粒的抗性 , 选择对应的平板 。
5. 挑取单克隆,并鉴定挑去平板上的单克隆培养,可以通过PCR或者酶切初步鉴定阳性克隆,对初步
鉴定出来的阳性克隆进行测序 。