imagej细胞计数|快速树突棘密度分析方法及细胞计数( 二 )

点击Analyze，Measure，可以看见此时计数数量为16个。当然也可以看最后右击时的数字即为树突棘总数。手动计数树突棘的计数操作与其他细胞类型的计数方法一致。

2、 Cell Counter插件进行手动计数
当需要计数的细胞有很多类型时采用上述方法1中Muliti point就不适用了。我们可以使用Plugins，Analyze，Cell Counter进行计数其优点是可以标记不同细胞的类型。其界面如下：

具体方法就是打开需要分析的图片，点击Plugins，Analyze，Cell Counter，点击Initialize，选择不同的类型（图中Type1——Type8）可以对不同类型的细胞进行计数。

本方法可以同时对不同类型的细胞进行计数，比如瘦长型、蘑菇型、短粗型及丝状伪足型4种不同类型的树突棘，可根据最开始的形态学图像的特点进行判别。点击Cell Counter中的Results就可以看见不同类型细胞的数量了。

3、自动计数
树突棘一般采用手动计数，今天开始给大家介绍的快速树突棘密度分析方法是比较快捷的方法。现在以细菌菌落为例示例自动计数基本过程。
打开图片：

转换RGB图像为灰度图片：Image，Type，8-bit 。
阈值选定，Image，Adjust，Thresho百思特网ld，阈值选定，红色代表选中。
皿边缘高亮部分影响菌落的选中，使用椭圆选框
大致选中菌落所在区域。

Analyze，Analyze particles，选择如下，点击OK，得到计数结果：