木星表面有红、褐、白等五彩缤纷的条纹图案，可以推测木星大气中的风向是平行于赤道方向，因区域的不同而交互吹著西风及东风，是木星大气的一向明显特征 。大气中含有极微的甲烷、乙炔之类的有机成份，而且有打雷现象生成有机物的机率相当大 。
大红斑与涡旋
木星的大红斑位于南纬23°处，东西长4万公里，南北宽1.3万公里 。探测器发现，大红斑是一团激烈上升的气流，呈深褐色 。这个彩色的气旋以逆时针方向转动 。在大红斑中心部分有个小颗粒，是大红斑的核，其大小约几百公里 。这个核在周围的反时针漩涡运动中维持不动 。大红斑的寿命很长，可维持几百年或更久 。大红斑的豔丽红色令人印象深刻，颜色似乎来自红磷 。

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鹅蛋形物体的自转是逆时针方向，周期大约是六天 。大红斑的维度是24，000至40，000千米X12，000至14，000千米 。它的直径大到可以容得下2至3颗地球 。这个风暴的最大高度比周围的云层高出约8km（5mi） 。
【世界之最知识|太阳系质量最大的行星 木星是太阳系中其它七大行星质量总和2.5倍】风暴通常都发生在巨行星大气层的湍流内，木星也有白色和棕色的鹅蛋形风暴，但较小的那些风暴通常都不会被命名 。白色的鹅蛋倾向于包含大气层上层，相对较低温的云 。棕色鹅蛋形是较温暖和位于普通云层 。这种风暴持续的时间可以只有几个小时，也可以长达数个世纪 。

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