按照《临时约法》的规定，袁世凯这个临时大总统是虚君，但作为一个善于玩弄权术的旧官僚，袁一心想扮演时代的主角 。不仅一贯强势的袁世凯不屑做虚君，就连他的身边人也不同意 。
就在这个节骨眼上，宋教仁又将同盟会等几个政党改组为国民党，推举孙中山为理事长 。同盟会本来就是参议院内第一大党，改组后更是占据了参议院大部分席位，孙中山会不会借议会选举卷土重来？这是袁世凯最担心的问题 。据总统府参议官唐在礼回忆，袁世凯邀请孙中山进京的目的之一，就是想“摸清孙中山究竟有些什么打算” 。经过20多天的接触，袁世凯对孙中山有了一个大体把握，孙离京之后，袁对身边人说：“孙中山志气高尚，见解亦超卓，但非实行家，徒居发起人之列耳 。”站在今天的角度看，袁世凯对孙中山的这个评价还算中肯 。
袁世凯的第二个目的是笼络孙中山，进而为自己所利用 。众所周知，当时并非北洋系的一统天下，孙中山在海内外有很高的威望，同盟会在参议院内占据绝对优势，并且黄兴领导的南京留守府还有不少部队，如果孙中山能够进京，会给袁世凯解决不少麻烦，一是表明袁氏当国众望所归，已经获得包括孙中山在内的全国上下一致支持;二是可以借孙的威望搞好与参议院的关系，为日后的选举做好铺垫 。
袁世凯想试探和笼络孙中山，那么，孙中山又有什么目的和想法呢？
孙袁会的旗号是共商国是、同促民国 。孙中山也在进京前表示，他北行的目的之一是“赞助袁大总统谋国利民福之政策” 。孙中山所说的“国利民福之政策”就是办实业、修铁路 。
除了修铁路，孙中山与袁世凯谈得最多的就是迁都了 。当年孙中山让位的条件之一就是要袁到南京就职，但袁世凯耍了个手腕蒙混过关，现在孙中山又旧话重提，在各种场合说起迁都之事，甚至连新都的地点都替袁世凯设计好了——南京、武昌或者开封 。孙中山之所以屡提起此事，其目的无非是让袁离开北方老巢，将其置于南方革命党人势力范围，最后怕袁不肯离开北京，所以又将他的老家河南作为替补 。
袁世凯答应了孙中山修铁路的要求，但对迁都一事一口回绝 。袁派孙去修铁路，一是投其所好，二是给这位革命领袖一个肥缺，让他安顿下来，免得继续革命或者造反 。
与孙中山不同，袁世凯的主要目标是抓住总统位子，据唐在礼回忆，孙袁会期间，袁世凯要孙中山“向全国公开表示永远不愿做大总统，专心为国家搞实业”，孙中山没有答应袁的这个要求，只是表示十年内不问政事，让袁世凯安心干满两届总统（《临时约法》规定总统任期五年，可连任一次） 。
从孙中山“十年不问政事”的承诺可以看出，他还有东山再起的想法，事实上到北京十天后，孙就公开表示：“十年之后，国民欲我出来服役，尚不为迟 。”这为日后的孙袁交恶埋下了伏笔，几个月后，国民党代理理事长宋教仁在上海沪宁车站遇刺身亡，“二次革命”随之爆发，孙中山重举反袁大旗，两人彻底决裂 。

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