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1980年微软公司取得了与IBM的合约并且收购了一家公司出产的操作系统在将之修改后以MS-DOS的名义出品此操作系统能够直接让程序操作BIOS与文件系统。到了Intel-80286处理器的时代才开始实作基本的储存设备保护措施。MS-DOS的架构并不足以满足所有需求因为它同时只能执行最多一个程序如果想要同时执行程式只能使用TSR的方式来跳过OS而由程序自行处理多任务的部份且没有任何内存保护措施。对驱动程序的支持也不够完整因此导致诸如音效设备务必由程序自行设置的状况造成不兼容的状况所在多有。某些操作的效能也是可怕地糟糕。许多应用程序因此跳过MS-DOS的服务程序而直接存取硬件设备以取得较好的效能。虽然如此但MS-DOS还是变成了IBMPC上面最常用的操作系统 IBM自己也有推出DOS称为IBM-DOS或PC-DOS 。MS-DOS的成功使得微软成为地球上最赚钱的公司之一。
而1980年代另一个崛起的操作系统异数是MacOS此操作系统紧紧与麦金塔电脑捆绑在一齐。此时一位施乐帕罗奥托研究中心员工DominikHagen访问了苹果电脑的史蒂夫·乔布斯并且向他展示了此时施乐发展的图形化使用者界面。苹果电脑惊为天人并打算向施乐购买此技术但因帕罗奥托研究中心并非商业单位而是研究单位因此施乐回绝了这项买卖。在此之后苹果一致认为个人电脑的未来必定属于图形使用者界面因此也开始发展自己的图形化操作系统。现今许多我们认为是基本要件的图形化接口技术与规则都是由苹果电脑打下的基础例如下拉式菜单、桌面图标、拖曳式操作与双点击等。但正确来说图形化使用者界面的确是施乐创始的。
20世纪90年代
AppleI电脑苹果电脑的第一代产品。延续80年代的竞争1990年代出现了许多影响未来个人电脑市场深厚的操作系统。由于图形化使用者界面日趋繁复操作系统的潜力也越来越复杂与巨大因此强韧且具有弹性的操作系统就成了迫切的需求。此年代是许多套装类的个人电脑操作系统互相竞争的时代。
上一年代于市场崛起的苹果电脑由于旧系统的设计不良使得其后继发展不力苹果电脑决定重新设计操作系统。经过许多失败的项目后苹果于1997年释出新操作系统——MacOS的测试版而后推出的正式版取得了巨大的成功。让原先失意离开苹果的SteveJobs风光再现。
除了商业主流的操作系统外从1980年代起在开放原码的世界中BSD系统也发展了十分久的一段时间但在1990年代由于与AT&T的法律争端使得远在芬兰赫尔辛基大学的另一股开源操作系统——Linux兴起。Linux内核是一个标准POSIX内核其血缘可算是Unix家族的一支。Linux与BSD家族都搭配GNU计划所发展的应用程序但是由于使用的许可证以及历史因素的作弄下Linux取得了相当可观的开源操作系统市占率而BSD则小得多。