朱之瑜教生产这事，在日本极其有名，还经常带学生实习，不是跑到农村教种地，就是到城里店铺里教手工技术，有次在油漆店里演示刷油漆，把围观群众看得叹服 。包括种地酿酒屠宰，只要他会的，全都热情传授 。以德川光国的深情回忆：先生为一经济家，假今日旷野无人之地，士农工商各业，先生皆可兼之 。
而这事对日本的冲击更是深远，明朝先进的生产技术从此大范围传播 。还有就是观念颠覆：日本传统的儒学鄙薄生产，但朱之瑜把生产的位置抬得极高 。以至于后来日本的诸多儒学门生，更有相当多的实干家 。十九世纪日本维新时代的诸多精英，正是在这样的土壤里孕育 。

而朱之瑜也知道，推广生产，传播实学，最直接的方式，就是办教育 。在这事上，他同样有独特创造：社会论 。与经济思想的“致用论”相同，朱之瑜教育思想的“社会论”，同样来自对明朝灭亡的沉重回忆 。在朱之瑜眼里，明朝的灭亡，首先是经济问题，然后就是教育问题 。以他自己的话说，明朝一直重视教育，但最后培养出来的，要么是道伪君子，要么是书呆子，明末为什么这种人多？说到底还是教育出问题 。
怎么解决这问题？这就是朱之瑜的“社会论”，学习目的要变，要为了造福社会而学习 。学习内容要变，不但要学道德，更要学为人的智慧与生产的知识，学到了就要用得着，学习方法要变，不能闭门学，学生更要充分的接地气 。教学方法也要变，再复杂的学问，都应该用通俗易懂的方式普及 。四书五经的学问，甚至被朱之瑜变成朗朗上口的日本儿歌，三岁小孩都能传颂 。
而对日本教育甚至当代教育影响最大的，更有朱之瑜“社会论”中特殊一条：教育普及 。永历二十四年，德川光国在水户设立学宫，朱之瑜亲自设计了学宫的样式营造，在学宫落成后，又制定了一套以中国儒家传统为基础的礼仪 。从头到尾，他都是这件大事的缔造者 。
而对德川幕府时代的文化， 影响尤其大的，就是朱之瑜的史学思想：尊史论 。早在青年读书时代起，朱之瑜就以史学见长，在客居日本之后，他也把自己卓越的史学思想，带给了日本人 。朱之瑜的“尊史论”，核心有俩条，一是尊重历史的事实，这条也解决了日本人修史的一个头疼问题：日本之前常年战乱，史料驳杂，德川幕府统治时期，想编修一部日本历史，却常年办不成 。
朱之瑜的“尊史论”出来，问题就解决了：朱之瑜认为，修史首先要有明确的历史观念，即强调国家统一，尊奉正朔 。而在目的上，“尊史论”的目标更现实：致用 。也就是他一直说的“经以史佐” 。朱之瑜的几位日本弟子们，启动了著名的修史运动，以朱之瑜弟子安积觉担任主编的《大日本史》修撰完成 。这部史书倡导的五大思想：尊王，抑藩，忠君，爱国，大一统 。更成为后来倒幕运动和明治维新的思想源头 。

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